Phần lớn khu vực Botum Sakor là đất thấp có độ dốc vừa phải, được bao phủ bởi các loài cây thường xanh và đồng cỏ trong khi vùng ven biển là đồng bằng ngập lũ với các loài thực vật ngập mặn và đầm lầy. Khí hậu đặc trưng ở đây là nhiệt đới gió mùa và khu vực này mỗi ngày có hai lần triều cường lên cao khoảng 1,5 mét. Dân số trong vườn quốc gia này chưa rõ ràng.